Magnify s'intègre avec la plupart des structures logicielles de sécurité d'entreprise pour contrôler l'accès aux informations confidentielles. La sécurité peut être configurée de plusieurs manières pour respecter des stratégies de sécurité variées. Les plug-ins de sécurité améliorent la capacité de Magnify pour authentifier les utilisateurs et autoriser les données sur lesquelles ils ont des droits d'accès.

La sécurité Magnify est assurée via l'architecture sécurité client WebFOCUS. Des informations de connexion sont requises pour accéder à un rapport sécurisé. Lorsque Magnify utilisent Lucene, les règles de sécurités sont ajoutées au déclencheur de données indexées par un programme de sécurité externe (security exit), celui-ci déterminant l'authentification de l'utilisateur et l'autorisation d'accès aux données.